急性尿道炎采用抗生素与化学药物联合应用，疗效较好。近来氟哌酸与磺胺药物联合应用，临床效果满意。全身治疗应注意休息，补充足够液体。在急性期间，应避免性生活，否则会延长病程。慢性期间，若尿道外口或尿道内有狭窄，应作尿道扩张术或尿道外口劈开术。对长期反复发作，全身用药效果不明显的慢性后尿道炎患者，可考虑尿道局部用药。

患者若有尿路刺激征，经常规抗菌治疗无效，且除外有复杂因素存在时，应考虑为支原体、衣原体或病毒感染，可首先使用四环素治疗。对四环素若有耐药性，则可改用红霉素、甲基红霉素或罗红霉素等。以上药物对支原体、衣原体有效。若经上述治疗仍无效，则可能为急性尿道综合征。

非淋菌性尿道炎是一种多病因的综合征，30%～50%的非淋菌性尿道炎与沙眼衣原体有关，20%～30%为解脲支原体感染，10%由阴道毛滴虫、白色念珠菌、单纯疱疹病毒、生殖支原体、腺病毒和杆菌等微生物引起衣原体和支原体对外环境抵抗力较弱，加热56°C，5～10分钟可将其杀死，常用消毒剂如福尔马林、来苏尔、石碳酸等也极易将其杀死。

淋菌性尿道炎常可引起各种并发症，在男性者如尿道狭窄、前列腺炎、膀胱炎，若上行传染时，可引起肾盂炎、肾盂肾炎、副睾炎，此外，若淋菌性尿道炎治疗不彻底或治疗不及时，常会导致一些并发症。　　

1、前列腺炎。当淋球菌向上侵犯到前列腺时可产生急性前列腺炎。　　

2、精囊炎。精囊和前列腺的导管相通，所以也常受淋菌的侵入而发生急性或慢性炎症。　　

3、附睾炎。多并发于淋菌性尿道炎的急性期，并发的主要原因是不合理的局部治疗和生活不检点，多因精囊的病变逆行感染而发生。　　

4、精液囊肿和不育。反复发作的病人可引起尿道狭窄，少数病人可以发生输精管狭窄和阻塞，进一步继发精液囊肿和不育。