初建

原是帕木竹巴（Phag-mo-gru，1110～1170）的弟子木雅贡仁（Mi-n~agsgon-rin%s）所建的小僧院，1179年时转让予止贡法主（H!bri-gun%chos-rje，1143～1217）。

止贡法主也是帕木竹巴的弟子。他在此扩建本寺，并创立止贡派。寺中的礼拜堂、僧房等建筑物，系依地势的高低而建，而由险峻的石块及阶梯相连，屹立在一万三千呎的高地上。在大讲堂的礼拜堂，有止贡法主的塔，安置法主像。讲堂收藏有黄金制的曼荼罗。

焚毁

13世纪晚期（1290年），止贡寺与萨迦寺发生纠葛，萨迦阿迦伦引蒙古帖木不花军入藏，蒙古军与萨迦派僧兵联合攻击止贡派，止贡不支溃败，蒙军遂焚烧止贡寺，史称‘止贡林变’或‘止贡寺颠覆事件’。

重建

1315年，多鲁修杰尔波（Rdo-rje rgyal-po）于此再建大塔。

规模建制

止贡巴·仁钦贝（1143～1217）是四川邓柯（今甘孜州西北部）人，属居热氏家族。他家世代信奉宁玛派（红教），父亲名俄羌多吉（持密金刚），母亲名宗玛。他6岁开始学习藏文，并在其父跟前闻习佛法，据说9岁时他便开始讲经说法。青年时期邓柯一带常遭受自然灾害，他就到康区给别人念经维持生活。后来拜帕木竹巴为师，闻习了帕木竹巴的教授后生起了照见一切法真实性的智慧，帕木竹巴又传授给他一种特殊的密法，使他名望逐渐提高。25岁时由贡塘喇嘛香松妥巴杜僧做屏教师给他授比丘戒（菩萨戒）。1177年至1179年他曾住持丹萨提寺三年，后因与寺僧不和而离任。

于1179年到墨竹工卡的止贡（元明文献称“必力工瓦”或“必拉公”；清文献中称“朱工”、“直谷”、“直工”、“都贡”等）地方，在原有小寺的基础上扩建成为一座大寺，这就是著名的止贡提寺。止贡巴的名字由此寺名而来，他所传的教派也就被称为“止贡噶举”（藏传佛教噶举派帕竹噶举支派之八小支派之一）。该派重戒律，认为以因果说和真实相融合，可以达到“真空”与“大悲”的境地。他的教授比较深奥；他的通达真实的弟子很多，遍及邬坚（今阿富汗）和那烂陀（印度一地名）、五台山等。

止贡噶举在西藏佛教界有一定的地位，止贡万户在十三万户（即后藏的拉堆洛、拉堆绛、固莫、曲米、蔡巴、唐波齐、帕摩竹和雅桑；前后藏交界处有羊卓达隆）中位列前藏之首。元朝初年，止贡得到旭烈兀（元世祖忽必烈之弟）的特别支持，常和萨迦派发生纠纷。1290年，萨迦本钦·阿迦仑奏请忽必烈派兵进藏攻入止贡峡谷，焚烧止贡提寺大经堂，摧毁18尊巨佛和7座多门塔，据说在这次战争中杀死止贡噶举派僧侣和属民一万多人，历史上称这次事件为“林洛”（意为寺院之变）。林洛以后，止贡噶举实力大为衰落，但在宗教方面仍有一定影响。到14世纪中叶，止贡噶举的实力又逐渐恢复，并且联合雅桑、蔡巴等万户与帕摩竹万户作战被打败，实力又一次削弱了。到明代，止贡噶举的领袖人物旺仁波且仁钦贝杰（止贡提寺第十三任寺主）于1413年（明永乐十一年）被明成祖封为阐教王。15世纪格鲁派兴起后，止贡噶举又抵制格鲁派被击败。到第五世达赖喇嘛阿旺·罗桑喜措受清朝顺治皇帝正式册封以后，止贡噶举不得不处于达赖喇嘛的管辖之下。从这时起，止贡噶举也采用了活佛转世制度。

寺院结构

止贡提寺主要由经堂、佛殿、藏经楼、坛城、护法神殿和修禅密室组成。其中被称为“世界一庄严”的灵塔殿最为壮观，高3层，主供杰觉巴灵塔，塔内装藏有噶举派历代祖师舍利子、印度8大持明和80位居士的衣物、金铜聚莲塔数十座、佛经和许多珍贵药材等。在扎西果芒殿内主供杰喇嘛塑像，其右侧供有2层楼高的大威德金刚泥塑像和金银质菩提大佛塔；南面为止贡历代法台的红色法座，极为神圣。

人文景观

止贡天葬场即止贡提坛城，藏语称“上贡替丹甲”。距止贡提寺仅10分钟路程。传说世界上最出名的天葬台有三个：一个在印度叫斯白天葬台，由密教大师龙树（南天竺人，生于佛灭后800年间，提倡中观性空之学）开辟，举世闻名的“神奇尸体讲故事”便是以斯白天葬台为背景产生的；一个在山南叫青朴天葬台；另一个在拉萨叫止贡天葬台，由止贡噶举大师杰觉巴·纪登贡布开辟。这三个天葬台中，止贡天葬台最大，有“止贡曲佳”之称，意思是永生永恒之地。离天葬台不远的6座佛塔是止贡活佛圆寂的灵塔，还有许多刻有经文的小石片，是人们为超度亡灵而刻写的。

贡康（护法神殿）内供有杰觉巴、释迦能仁、龙树大师等塑像，供有杰觉巴脚印、止贡护法神阿杰确吉卓玛金铜塑像及铜质佛像数百尊。修禅密室散落在主殿四周，只有一个小木门和一个小窗户，面积6～7平方米。据说有二十多名喇嘛正在修禅，有的喇嘛快修满三年三个月零三天。修满者可得到“仓巴”（修禅者）的称号，时间长者为三年三个月零三天，短者也要三个月。拙火定（即修丹田生热的脐轮火法）是噶举派的一种密法，也是该寺一大特色。该寺修成拙火定的只有2人：巴穷仁布切（已于1990年94岁时圆寂）和丹增尼玛。修成拙火定的人能在冬天将刚从水中捞出的袈裟披在身上烤干；如果下了雪，他在屋内发功后屋顶上的雪即刻可以融化。

灵魂超度

止贡堤寺灵魂超度独具特色，它能使灵魂出窍。这种灌顶方法只有该寺的活佛才能施行。佛教认为，人死后灵魂有可能进入“三善趣”（即天、人、阿修罗）；也有可能进入“三恶趣”（即地狱、饿鬼、畜生）。如果通过止贡提寺活佛“灌顶”（佛以大悲水灌顶、能使功德圆满），在死者头上打一个洞，灵魂就会从头上出来进入三善趣。如果不灌顶，只要你到止贡提寺天葬场用头轻轻碰那里的嘛呢石，死后也会进入三善趣。

金刚神舞

止贡提寺每年藏历3月28～29日要跳金刚神舞。从藏历2月开云贵，全寺僧人便集中诵经，持续一个月。念经期间，用彩粉绘制坛城，用糌粑做一个人形怪物“棱嘎”，被当作教敌或邪恶的化身。3月28～29日正式表演神舞。众神要把“棱嘎”砍成啐块用火烧掉，象征教敌与邪魔已被斩尽，教法如旭日东升庇护众生。