生蚝中的黑色物质主要是肠腺和一些未被消化的藻类物质。一般不建议食用。此外，生蚝生活的水环境是不透水和泥泞的。容易滋生细菌等有害物质，可能含有沉淀物。食用后会影响肠胃健康，引起腹痛、腹泻等不适症状。

建议在食用前将生蚝放入盐水中浸泡1-2小时，以尽可能代谢掉所有的沉淀物。2小时后把盐水倒掉，里面会有很多黑色的东西和淤泥，这就是生蚝里的黑色东西。

海蛎子也叫牡蛎，很多地方牡蛎和生蚝是不分的。但严格说来，生蚝和海蛎子之间是有区别的。生蚝通常更大，肉质更饱满，外壳更光滑。个头大的带壳生蚝可以超过一斤，而海蛎子则不那么大。通常，小牡蛎被称为海蛎子，大牡蛎被称为生蚝。生蚝可以在去壳后直接食用，而海蛎子的味道要比生牡蛎的味道差得多，而且不适合生食，因此需要在食用前先煮熟。含锌量上，相同重量的海蛎子的锌含量与生蚝略有不同。每100克生蚝中的锌含量为71.2mg，而相同重量的海蛎子中的锌含量仅为9.39mg。

生蚝煮熟后可以打开壳；带壳生蚝最好的烹调方法是蒸而不是煮，蒸的方法可以最大程度地保持鲜味和独特的味道。可煮汤、腌制、烤制、软炸，也可制成罐头食品，还可加工成蚝油或干蚝、蚝油。